fix: Improve conda env listing and ensure base is included (fdf0a2ec) · Commits · Research Enablement / Xylem

lcov.info

+93 −80

Original line number	Diff line number	Diff line
		@@ -51,7 +51,6 @@ DA:75,0
		DA:76,0
		DA:77,0
		DA:78,0
		DA:79,0
		DA:81,0
		DA:84,0
		DA:90,0
		@@ -79,7 +78,6 @@ DA:118,0
		DA:119,0
		DA:120,0
		DA:121,0
		DA:122,0
		DA:124,0
		DA:125,0
		DA:126,0
		@@ -93,8 +91,7 @@ DA:137,0
		DA:138,0
		DA:140,0
		DA:141,0
		DA:143,0
		LF:71
		LF:68
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		@@ -137,6 +134,10 @@ DA:61,0
		DA:62,0
		DA:64,0
		DA:65,0
		DA:66,0
		DA:67,0
		DA:68,0
		DA:69,0
		DA:72,0
		DA:73,0
		DA:74,0
		@@ -151,8 +152,7 @@ DA:87,0
		DA:90,0
		DA:91,0
		DA:96,0
		DA:98,0
		LF:41
		LF:44
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		@@ -165,10 +165,21 @@ DA:27,0
		DA:28,0
		DA:29,0
		DA:31,0
		DA:32,0
		DA:33,0
		DA:34,0
		DA:35,0
		DA:36,0
		DA:38,0
		DA:42,0
		DA:43,0
		DA:44,0
		DA:45,0
		DA:46,0
		DA:47,0
		DA:50,0
		DA:51,0
		DA:52,0
		DA:56,0
		DA:57,0
		DA:68,0
		@@ -179,7 +190,7 @@ DA:87,0
		DA:88,0
		DA:89,0
		DA:91,0
		LF:19
		LF:30
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		@@ -210,7 +221,6 @@ DA:29,0
		DA:30,0
		DA:37,0
		DA:38,0
		DA:40,0
		DA:43,0
		DA:44,0
		DA:45,0
		@@ -221,7 +231,7 @@ DA:53,0
		DA:54,0
		DA:57,0
		DA:59,0
		LF:30
		LF:29
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		@@ -268,8 +278,7 @@ FN:5,run
		FNF:1
		FNDA:0,run
		DA:5,0
		DA:6,0
		LF:2
		LF:1
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		@@ -319,7 +328,7 @@ DA:140,1
		DA:141,1
		DA:142,1
		DA:143,2
		DA:144,2
		DA:144,3
		DA:146,3
		DA:147,2
		DA:148,1
		@@ -331,8 +340,8 @@ DA:160,1
		DA:161,0
		DA:166,0
		DA:169,1
		DA:170,2
		DA:173,2
		DA:170,1
		DA:173,3
		DA:175,2
		DA:184,0
		DA:185,0
		@@ -466,11 +475,11 @@ DA:433,2
		DA:434,2
		DA:436,0
		DA:437,0
		DA:440,5
		DA:440,2
		DA:441,4
		DA:442,8
		DA:443,0
		DA:445,12
		DA:445,8
		DA:446,4
		DA:453,1
		DA:454,2
		@@ -481,7 +490,7 @@ DA:461,2
		DA:462,1
		DA:463,2
		DA:464,0
		DA:466,3
		DA:466,2
		DA:467,1
		DA:473,0
		DA:474,0
		@@ -591,7 +600,7 @@ DA:101,2
		DA:102,1
		DA:103,2
		DA:104,0
		DA:106,3
		DA:106,2
		DA:107,1
		DA:109,1
		DA:110,1
		@@ -601,9 +610,9 @@ DA:113,0
		DA:115,0
		DA:120,1
		DA:121,1
		DA:122,3
		DA:123,3
		DA:124,3
		DA:122,1
		DA:123,1
		DA:124,1
		LF:25
		LH:20
		end_of_record
		@@ -689,19 +698,19 @@ FNDA:0,ScriptTemplate::resolve_python_virtual_environment
		FNDA:1,StringTemplate::new
		FNDA:1,StringTemplate::expand
		FNDA:1,StringTemplate::get_variable
		FNDA:1,StringTemplate::is_handlebars
		FNDA:2,StringTemplate::is_handlebars
		FNDA:1,StringTemplate::remove_spaces
		FNDA:1,get_conda_environment_list
		DA:300,1
		DA:301,2
		DA:302,1
		DA:303,3
		DA:304,2
		DA:306,3
		DA:303,2
		DA:304,3
		DA:306,2
		DA:307,1
		DA:310,0
		DA:311,0
		DA:316,3
		DA:316,2
		DA:317,1
		DA:324,1
		DA:325,1
		@@ -729,9 +738,9 @@ DA:355,0
		DA:357,0
		DA:359,1
		DA:360,1
		DA:361,2
		DA:362,2
		DA:363,2
		DA:361,1
		DA:362,3
		DA:363,3
		DA:364,2
		DA:365,1
		DA:369,0
		@@ -747,7 +756,6 @@ DA:384,0
		DA:385,0
		DA:386,0
		DA:390,0
		DA:391,0
		DA:393,0
		DA:397,2
		DA:398,2
		@@ -762,9 +770,8 @@ DA:409,1
		DA:410,1
		DA:411,1
		DA:412,0
		DA:414,2
		DA:418,2
		DA:419,2
		DA:418,3
		DA:419,3
		DA:421,2
		DA:422,2
		DA:424,2
		@@ -775,6 +782,7 @@ DA:434,0
		DA:435,0
		DA:437,0
		DA:438,0
		DA:439,0
		DA:441,0
		DA:442,0
		DA:443,0
		@@ -789,12 +797,12 @@ DA:461,0
		DA:462,0
		DA:467,1
		DA:468,1
		DA:469,2
		DA:469,1
		DA:470,1
		DA:487,1
		DA:488,2
		DA:491,2
		DA:492,1
		DA:488,1
		DA:491,3
		DA:492,2
		DA:493,2
		DA:494,1
		DA:495,1
		@@ -802,12 +810,15 @@ DA:497,2
		DA:501,1
		DA:502,1
		DA:522,1
		DA:523,2
		DA:526,2
		DA:527,1
		DA:523,1
		DA:526,3
		DA:527,2
		DA:528,2
		DA:529,2
		DA:532,2
		DA:529,1
		DA:530,1
		DA:531,1
		DA:532,3
		DA:533,1
		DA:534,1
		DA:536,2
		DA:540,1
		@@ -843,13 +854,14 @@ DA:617,1
		DA:630,1
		DA:631,1
		DA:632,3
		DA:636,2
		DA:638,2
		DA:640,2
		DA:633,1
		DA:636,3
		DA:638,1
		DA:640,3
		DA:644,1
		DA:645,1
		DA:646,1
		DA:648,2
		DA:648,1
		DA:650,1
		DA:651,1
		DA:652,1
		@@ -908,9 +920,9 @@ DA:732,0
		DA:737,0
		DA:741,1
		DA:742,2
		DA:743,2
		DA:743,1
		DA:744,2
		DA:745,3
		DA:745,1
		DA:746,1
		DA:748,0
		DA:749,0
		@@ -921,19 +933,19 @@ DA:763,1
		DA:764,1
		DA:765,2
		DA:766,2
		DA:767,3
		DA:767,2
		DA:768,1
		DA:769,7
		DA:769,3
		DA:770,2
		DA:771,1
		DA:771,2
		DA:772,1
		DA:773,1
		DA:774,1
		DA:779,2
		DA:779,4
		DA:780,1
		DA:782,0
		DA:783,0
		DA:786,1
		DA:786,2
		DA:787,1
		DA:788,2
		DA:789,2
		@@ -950,8 +962,8 @@ DA:806,2
		DA:807,1
		DA:808,3
		DA:809,1
		DA:810,3
		DA:811,3
		DA:810,2
		DA:811,2
		DA:812,1
		DA:814,0
		DA:815,0
		@@ -995,40 +1007,41 @@ DA:920,0
		DA:921,0
		DA:922,0
		DA:932,1
		DA:934,1
		DA:934,2
		DA:941,1
		DA:942,4
		DA:942,3
		DA:943,3
		DA:948,1
		DA:949,2
		DA:950,2
		DA:950,3
		DA:951,1
		DA:952,2
		DA:954,0
		DA:978,1
		DA:979,2
		DA:980,2
		DA:981,1
		DA:978,2
		DA:979,4
		DA:980,3
		DA:981,2
		DA:982,0
		DA:984,0
		DA:1013,1
		DA:1014,2
		DA:1015,2
		DA:1015,1
		DA:1016,0
		DA:1018,3
		DA:1019,1
		DA:1023,1
		DA:1024,2
		DA:1024,1
		DA:1025,2
		DA:1026,2
		DA:1026,1
		DA:1027,2
		DA:1028,5
		DA:1031,1
		DA:1033,2
		DA:1035,4
		DA:1038,0
		LF:335
		LH:182
		DA:1028,4
		DA:1031,2
		DA:1033,3
		DA:1035,5
		DA:1036,3
		DA:1039,0
		LF:339
		LH:186
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/pipe/pipe-lib/src/util.rs
		@@ -1121,7 +1134,7 @@ DA:82,4
		DA:86,1
		DA:87,2
		DA:88,2
		DA:90,4
		DA:90,2
		DA:94,1
		DA:95,2
		DA:96,0
		@@ -1145,10 +1158,10 @@ DA:120,0
		DA:121,0
		DA:122,0
		DA:148,1
		DA:149,2
		DA:149,3
		DA:150,2
		DA:151,1
		DA:152,6
		DA:152,3
		DA:164,1
		DA:166,0
		DA:168,1
		@@ -1159,7 +1172,7 @@ DA:187,2
		DA:202,3
		DA:203,3
		DA:206,1
		DA:207,3
		DA:207,2
		DA:219,1
		DA:220,1
		DA:223,0
		@@ -1177,19 +1190,19 @@ DA:249,1
		DA:251,2
		DA:252,1
		DA:253,1
		DA:255,3
		DA:255,2
		DA:268,2
		DA:269,2
		DA:270,4
		DA:271,3
		DA:272,9
		DA:272,6
		DA:273,6
		DA:275,1
		DA:276,3
		DA:276,2
		DA:277,1
		DA:280,1
		DA:282,1
		DA:283,3
		DA:283,4
		DA:285,1
		DA:286,4
		LF:117

pipe-lib/src/script.rs

+3 −2

Original line number	Diff line number	Diff line
		@@ -21,7 +21,7 @@ use which::which;

		use crate::util::*;

		pub type CommandResult = Result<(), Box<(dyn StdError + 'static)>>;
		pub type CommandResult = Result<(), Box<dyn StdError + 'static>>;

		#[derive(Clone, Debug, Display, Serialize, Deserialize, Valuable)]
		#[serde(rename_all = "lowercase")]
		@@ -1031,8 +1031,9 @@ pub fn get_conda_environment_list() -> Vec<String> {
		.replace(['#', '*'], "")
		.split('\n')
		.filter(\|x\| !x.is_empty())
		.skip(2)
		.skip(1)
		.map(\|x\| x.trim().chars().take_while(\|x\| !x.is_whitespace()).collect())
		.filter(\|x: &String\| !x.contains(std::path::is_separator))
		.collect::<Vec<String>>()
		} else {
		vec![]