feat: Support configuring run options from config.json (eb5cfb8e) · Commits · Research Enablement / Xylem

Cargo.lock

+1 −0

Original line number	Diff line number	Diff line
		@@ -2248,6 +2248,7 @@ dependencies = [
		"glob",
		"indicatif",
		"nanoid",
		"owo-colors 4.0.0",
		"pipe-lib",
		"rayon",
		"serde",

Cargo.toml

+1 −0

Original line number	Diff line number	Diff line
		@@ -16,6 +16,7 @@ clap-verbosity-flag = "2.2.0"
		color-eyre = "0.6.3"
		dotenvy = "0.15.0"
		exitcode = "1.1.2"
		owo-colors = "4.0.0"
		rayon = "1.7.0"
		serde = { version = "1.0.188", features = ["derive"] }
		serde_json = "1.0.107"

lcov.info

+356 −343

Original line number	Diff line number	Diff line
		@@ -108,37 +108,46 @@ LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/command/pipe-cli/src/commands/run/mod.rs
		FN:13,run
		FN:14,run
		FNF:1
		FNDA:0,run
		DA:13,0
		DA:23,0
		DA:14,0
		DA:24,0
		DA:25,0
		DA:27,0
		DA:26,0
		DA:28,0
		DA:30,0
		DA:32,0
		DA:29,0
		DA:31,0
		DA:33,0
		DA:34,0
		DA:36,0
		DA:35,0
		DA:37,0
		DA:39,0
		DA:38,0
		DA:40,0
		DA:41,0
		DA:44,0
		DA:42,0
		DA:45,0
		DA:46,0
		DA:47,0
		DA:53,0
		DA:48,0
		DA:55,0
		DA:56,0
		DA:57,0
		DA:58,0
		DA:59,0
		DA:60,0
		DA:61,0
		DA:64,0
		DA:65,0
		DA:62,0
		DA:69,0
		DA:71,0
		LF:27
		DA:70,0
		DA:75,0
		DA:76,0
		DA:77,0
		DA:78,0
		DA:81,0
		DA:82,0
		DA:86,0
		DA:88,0
		LF:36
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		@@ -298,45 +307,46 @@ FN:1098,Label::read
		FN:1102,Label::rejected
		FN:1106,Label::run
		FN:1110,Label::using
		FN:1116,ModuleUri<'_>::from
		FN:1126,ModuleUri<'_>::hash
		FN:1150,ModuleUri<'_>::get_whitelist
		FN:1153,ModuleUri<'_>::is_allowed
		FN:1156,ModuleUri<'_>::test
		FN:1157,ModuleUri<'_>::test::check
		FN:1174,ModuleUri<'_>::working_directory
		FN:1188,<impl Deref for PyProjectToml>::deref
		FN:1193,PyProjectToml::read
		FN:1209,PyProjectToml::get_module_name
		FN:1220,SemanticVersion::from_string
		FN:1229,Script::ensure_relative
		FN:1248,Script::expand_arguments
		FN:1283,Script::expand_arguments_from
		FN:1318,Script::from_module
		FN:1376,Script::from_path
		FN:1391,Script::from_template
		FN:1411,Script::get_command
		FN:1421,Script::get_arguments
		FN:1461,Script::maybe_create_virtual_environment
		FN:1502,Script::maybe_git_clone
		FN:1509,Script::python_default
		FN:1523,Script::run
		FN:1590,Script::with_container
		FN:1597,Script::with_current_dir
		FN:1602,Script::with_envs
		FN:1644,Script::with_virtual_environment
		FN:1650,ScriptTemplate::from_path
		FN:1662,ScriptTemplate::resolve_python_virtual_environment
		FN:1690,StringTemplate::new
		FN:1699,StringTemplate::expand
		FN:1706,StringTemplate::get_variable
		FN:1736,StringTemplate::is_handlebars
		FN:1771,StringTemplate::remove_spaces
		FN:1781,add_dot_slash
		FN:1789,add_forward_slash
		FN:1796,download_binary
		FN:1797,download_binary::download
		FNF:76
		FN:1113,Label::fmt_using
		FN:1119,ModuleUri<'_>::from
		FN:1129,ModuleUri<'_>::hash
		FN:1153,ModuleUri<'_>::get_whitelist
		FN:1156,ModuleUri<'_>::is_allowed
		FN:1159,ModuleUri<'_>::test
		FN:1160,ModuleUri<'_>::test::check
		FN:1177,ModuleUri<'_>::working_directory
		FN:1191,<impl Deref for PyProjectToml>::deref
		FN:1196,PyProjectToml::read
		FN:1212,PyProjectToml::get_module_name
		FN:1223,SemanticVersion::from_string
		FN:1232,Script::ensure_relative
		FN:1251,Script::expand_arguments
		FN:1286,Script::expand_arguments_from
		FN:1321,Script::from_module
		FN:1379,Script::from_path
		FN:1394,Script::from_template
		FN:1414,Script::get_command
		FN:1424,Script::get_arguments
		FN:1464,Script::maybe_create_virtual_environment
		FN:1505,Script::maybe_git_clone
		FN:1512,Script::python_default
		FN:1526,Script::run
		FN:1593,Script::with_container
		FN:1600,Script::with_current_dir
		FN:1605,Script::with_envs
		FN:1647,Script::with_virtual_environment
		FN:1653,ScriptTemplate::from_path
		FN:1665,ScriptTemplate::resolve_python_virtual_environment
		FN:1693,StringTemplate::new
		FN:1702,StringTemplate::expand
		FN:1709,StringTemplate::get_variable
		FN:1739,StringTemplate::is_handlebars
		FN:1774,StringTemplate::remove_spaces
		FN:1784,add_dot_slash
		FN:1792,add_forward_slash
		FN:1799,download_binary
		FN:1800,download_binary::download
		FNF:77
		FNDA:1,Command::test
		FNDA:0,Config::get_environment_variables
		FNDA:1,Config::get_inputs
		@@ -369,12 +379,13 @@ FNDA:0,Label::found
		FNDA:0,Label::not_found
		FNDA:0,Label::fmt_not_found
		FNDA:1,Label::output
		FNDA:5,Label::fmt_output
		FNDA:1,Label::fmt_output
		FNDA:0,Label::pass
		FNDA:0,Label::read
		FNDA:0,Label::rejected
		FNDA:0,Label::run
		FNDA:0,Label::using
		FNDA:4,Label::using
		FNDA:4,Label::fmt_using
		FNDA:2,ModuleUri<'_>::from
		FNDA:1,ModuleUri<'_>::hash
		FNDA:0,ModuleUri<'_>::get_whitelist
		@@ -737,10 +748,10 @@ DA:1083,0
		DA:1084,0
		DA:1085,0
		DA:1087,1
		DA:1088,5
		DA:1090,5
		DA:1091,5
		DA:1092,5
		DA:1088,1
		DA:1090,1
		DA:1091,1
		DA:1092,1
		DA:1094,0
		DA:1095,0
		DA:1096,0
		@@ -753,316 +764,315 @@ DA:1104,0
		DA:1106,0
		DA:1107,0
		DA:1108,0
		DA:1110,0
		DA:1111,0
		DA:1112,0
		DA:1116,2
		DA:1117,2
		DA:1118,3
		DA:1119,1
		DA:1110,4
		DA:1111,4
		DA:1113,4
		DA:1114,4
		DA:1115,4
		DA:1119,2
		DA:1120,2
		DA:1121,0
		DA:1123,1
		DA:1121,3
		DA:1122,1
		DA:1123,2
		DA:1124,0
		DA:1126,1
		DA:1127,1
		DA:1128,1
		DA:1129,1
		DA:1130,1
		DA:1131,0
		DA:1133,2
		DA:1137,2
		DA:1138,2
		DA:1131,1
		DA:1132,1
		DA:1133,1
		DA:1134,0
		DA:1136,2
		DA:1140,2
		DA:1141,2
		DA:1143,2
		DA:1146,0
		DA:1150,0
		DA:1151,0
		DA:1144,2
		DA:1146,2
		DA:1149,0
		DA:1153,0
		DA:1154,0
		DA:1156,0
		DA:1157,0
		DA:1158,0
		DA:1159,0
		DA:1160,0
		DA:1161,0
		DA:1162,0
		DA:1163,0
		DA:1164,0
		DA:1165,0
		DA:1166,0
		DA:1167,0
		DA:1168,0
		DA:1170,0
		DA:1174,0
		DA:1175,0
		DA:1176,0
		DA:1169,0
		DA:1171,0
		DA:1173,0
		DA:1177,0
		DA:1178,0
		DA:1179,0
		DA:1180,0
		DA:1181,0
		DA:1188,1
		DA:1193,1
		DA:1194,2
		DA:1195,2
		DA:1197,0
		DA:1198,0
		DA:1201,2
		DA:1202,1
		DA:1203,2
		DA:1204,0
		DA:1206,3
		DA:1207,1
		DA:1209,1
		DA:1183,0
		DA:1184,0
		DA:1191,1
		DA:1196,1
		DA:1197,2
		DA:1198,2
		DA:1200,0
		DA:1201,0
		DA:1204,2
		DA:1205,1
		DA:1206,2
		DA:1207,0
		DA:1209,3
		DA:1210,1
		DA:1211,1
		DA:1212,1
		DA:1213,0
		DA:1215,0
		DA:1220,1
		DA:1221,1
		DA:1222,3
		DA:1223,3
		DA:1224,3
		DA:1229,1
		DA:1230,1
		DA:1231,2
		DA:1213,1
		DA:1214,1
		DA:1215,1
		DA:1216,0
		DA:1218,0
		DA:1223,1
		DA:1224,1
		DA:1225,3
		DA:1226,3
		DA:1227,3
		DA:1232,1
		DA:1248,1
		DA:1249,2
		DA:1233,1
		DA:1234,2
		DA:1235,1
		DA:1251,1
		DA:1252,2
		DA:1253,1
		DA:1254,2
		DA:1255,1
		DA:1255,2
		DA:1256,1
		DA:1258,2
		DA:1262,1
		DA:1263,1
		DA:1283,1
		DA:1284,2
		DA:1257,2
		DA:1258,1
		DA:1259,1
		DA:1261,2
		DA:1265,1
		DA:1266,1
		DA:1286,1
		DA:1287,2
		DA:1288,1
		DA:1289,2
		DA:1290,2
		DA:1291,1
		DA:1292,2
		DA:1293,2
		DA:1295,1
		DA:1297,2
		DA:1301,1
		DA:1302,1
		DA:1318,0
		DA:1320,0
		DA:1296,2
		DA:1298,1
		DA:1300,2
		DA:1304,1
		DA:1305,1
		DA:1321,0
		DA:1322,0
		DA:1323,0
		DA:1324,0
		DA:1325,0
		DA:1326,0
		DA:1327,0
		DA:1328,0
		DA:1329,0
		DA:1330,0
		DA:1331,0
		DA:1332,0
		DA:1333,0
		DA:1334,0
		DA:1335,0
		DA:1336,0
		DA:1337,0
		DA:1338,0
		DA:1339,0
		DA:1340,0
		DA:1341,0
		DA:1342,0
		DA:1343,0
		DA:1344,0
		DA:1345,0
		DA:1346,0
		DA:1347,0
		DA:1349,0
		DA:1350,0
		DA:1352,0
		DA:1353,0
		DA:1359,0
		DA:1360,0
		DA:1376,1
		DA:1377,1
		DA:1378,1
		DA:1391,1
		DA:1392,1
		DA:1393,3
		DA:1397,2
		DA:1399,2
		DA:1401,2
		DA:1405,1
		DA:1406,1
		DA:1407,1
		DA:1409,2
		DA:1411,1
		DA:1412,1
		DA:1413,1
		DA:1356,0
		DA:1362,0
		DA:1363,0
		DA:1379,1
		DA:1380,1
		DA:1381,1
		DA:1394,1
		DA:1395,1
		DA:1396,3
		DA:1400,2
		DA:1402,2
		DA:1404,2
		DA:1408,1
		DA:1409,1
		DA:1410,1
		DA:1412,2
		DA:1414,1
		DA:1416,1
		DA:1417,2
		DA:1418,1
		DA:1415,1
		DA:1416,2
		DA:1417,1
		DA:1419,1
		DA:1420,2
		DA:1421,1
		DA:1422,1
		DA:1423,1
		DA:1424,1
		DA:1425,2
		DA:1426,1
		DA:1427,0
		DA:1429,0
		DA:1425,1
		DA:1426,2
		DA:1427,2
		DA:1428,2
		DA:1429,1
		DA:1430,0
		DA:1433,4
		DA:1434,2
		DA:1436,1
		DA:1438,1
		DA:1432,0
		DA:1433,0
		DA:1436,4
		DA:1437,2
		DA:1439,1
		DA:1440,1
		DA:1441,2
		DA:1442,2
		DA:1444,1
		DA:1446,2
		DA:1447,2
		DA:1449,0
		DA:1450,0
		DA:1453,1
		DA:1454,1
		DA:1441,1
		DA:1442,1
		DA:1443,1
		DA:1444,2
		DA:1445,2
		DA:1447,1
		DA:1449,2
		DA:1450,2
		DA:1452,0
		DA:1453,0
		DA:1456,1
		DA:1461,0
		DA:1462,0
		DA:1463,0
		DA:1457,1
		DA:1459,1
		DA:1464,0
		DA:1465,0
		DA:1466,0
		DA:1467,0
		DA:1468,0
		DA:1469,0
		DA:1470,0
		DA:1471,0
		DA:1472,0
		DA:1473,0
		DA:1474,0
		DA:1475,0
		DA:1476,0
		DA:1477,0
		DA:1478,0
		DA:1479,0
		DA:1480,0
		DA:1481,0
		DA:1482,0
		DA:1484,0
		DA:1485,0
		DA:1489,0
		DA:1490,0
		DA:1488,0
		DA:1492,0
		DA:1493,0
		DA:1498,0
		DA:1502,1
		DA:1503,2
		DA:1504,2
		DA:1505,2
		DA:1506,3
		DA:1507,1
		DA:1509,0
		DA:1510,0
		DA:1511,0
		DA:1519,0
		DA:1523,1
		DA:1524,1
		DA:1525,1
		DA:1526,2
		DA:1527,2
		DA:1528,3
		DA:1529,1
		DA:1530,7
		DA:1531,2
		DA:1496,0
		DA:1501,0
		DA:1505,1
		DA:1506,2
		DA:1507,2
		DA:1508,2
		DA:1509,3
		DA:1510,1
		DA:1512,0
		DA:1513,0
		DA:1514,0
		DA:1522,0
		DA:1526,1
		DA:1527,1
		DA:1528,1
		DA:1529,2
		DA:1530,2
		DA:1531,3
		DA:1532,1
		DA:1533,1
		DA:1534,1
		DA:1533,7
		DA:1534,2
		DA:1535,1
		DA:1540,2
		DA:1541,1
		DA:1543,0
		DA:1544,0
		DA:1547,1
		DA:1548,1
		DA:1549,2
		DA:1550,2
		DA:1536,1
		DA:1537,1
		DA:1538,1
		DA:1543,2
		DA:1544,1
		DA:1546,0
		DA:1547,0
		DA:1550,1
		DA:1551,1
		DA:1552,2
		DA:1553,2
		DA:1554,1
		DA:1556,0
		DA:1557,0
		DA:1560,1
		DA:1561,1
		DA:1562,2
		DA:1563,3
		DA:1564,2
		DA:1556,2
		DA:1557,1
		DA:1559,0
		DA:1560,0
		DA:1563,1
		DA:1564,1
		DA:1565,2
		DA:1566,3
		DA:1567,2
		DA:1568,1
		DA:1569,3
		DA:1570,1
		DA:1571,3
		DA:1570,2
		DA:1571,1
		DA:1572,3
		DA:1573,1
		DA:1575,0
		DA:1576,0
		DA:1577,0
		DA:1574,3
		DA:1575,3
		DA:1576,1
		DA:1578,0
		DA:1579,0
		DA:1580,0
		DA:1581,0
		DA:1582,0
		DA:1586,0
		DA:1587,0
		DA:1590,1
		DA:1591,1
		DA:1592,1
		DA:1597,1
		DA:1598,2
		DA:1599,1
		DA:1602,0
		DA:1603,0
		DA:1604,0
		DA:1644,1
		DA:1645,2
		DA:1646,1
		DA:1650,1
		DA:1651,2
		DA:1652,1
		DA:1654,0
		DA:1655,0
		DA:1658,2
		DA:1660,1
		DA:1662,0
		DA:1663,0
		DA:1664,0
		DA:1583,0
		DA:1584,0
		DA:1585,0
		DA:1589,0
		DA:1590,0
		DA:1593,1
		DA:1594,1
		DA:1595,1
		DA:1600,1
		DA:1601,2
		DA:1602,1
		DA:1605,0
		DA:1606,0
		DA:1607,0
		DA:1647,1
		DA:1648,2
		DA:1649,2
		DA:1653,1
		DA:1654,2
		DA:1655,1
		DA:1657,0
		DA:1658,0
		DA:1661,2
		DA:1663,1
		DA:1665,0
		DA:1666,0
		DA:1667,0
		DA:1668,0
		DA:1669,0
		DA:1670,0
		DA:1671,0
		DA:1672,0
		DA:1673,0
		DA:1678,0
		DA:1679,0
		DA:1680,0
		DA:1690,1
		DA:1692,1
		DA:1699,1
		DA:1700,4
		DA:1701,3
		DA:1706,1
		DA:1707,2
		DA:1708,2
		DA:1674,0
		DA:1675,0
		DA:1676,0
		DA:1681,0
		DA:1682,0
		DA:1683,0
		DA:1693,1
		DA:1695,1
		DA:1702,1
		DA:1703,4
		DA:1704,3
		DA:1709,1
		DA:1710,2
		DA:1712,0
		DA:1736,1
		DA:1737,2
		DA:1738,2
		DA:1711,2
		DA:1712,1
		DA:1713,2
		DA:1715,0
		DA:1739,1
		DA:1740,0
		DA:1742,0
		DA:1771,1
		DA:1772,2
		DA:1773,1
		DA:1774,0
		DA:1776,3
		DA:1777,1
		DA:1781,1
		DA:1782,2
		DA:1783,2
		DA:1785,4
		DA:1789,1
		DA:1790,2
		DA:1791,0
		DA:1740,2
		DA:1741,2
		DA:1742,1
		DA:1743,0
		DA:1745,0
		DA:1774,1
		DA:1775,2
		DA:1776,1
		DA:1777,0
		DA:1779,3
		DA:1780,1
		DA:1784,1
		DA:1785,2
		DA:1786,2
		DA:1788,4
		DA:1792,1
		DA:1793,2
		DA:1796,0
		DA:1797,0
		DA:1798,0
		DA:1794,0
		DA:1796,2
		DA:1799,0
		DA:1800,0
		DA:1801,0
		@@ -1072,70 +1082,73 @@ DA:1804,0
		DA:1805,0
		DA:1806,0
		DA:1807,0
		DA:1808,0
		DA:1809,0
		DA:1811,0
		DA:1810,0
		DA:1812,0
		DA:1814,0
		DA:1815,0
		DA:1816,0
		DA:1817,0
		DA:1832,1
		DA:1833,1
		DA:1834,4
		DA:1835,2
		DA:1839,1
		DA:1840,2
		DA:1841,2
		DA:1842,2
		DA:1818,0
		DA:1819,0
		DA:1820,0
		DA:1835,1
		DA:1836,1
		DA:1837,4
		DA:1838,2
		DA:1842,1
		DA:1843,2
		DA:1844,5
		DA:1847,1
		DA:1849,2
		DA:1851,4
		DA:1854,0
		DA:1881,1
		DA:1882,2
		DA:1883,2
		DA:1844,2
		DA:1845,2
		DA:1846,2
		DA:1847,5
		DA:1850,1
		DA:1852,2
		DA:1854,4
		DA:1857,0
		DA:1884,1
		DA:1885,6
		DA:1897,1
		DA:1899,0
		DA:1901,1
		DA:1916,3
		DA:1917,3
		DA:1920,1
		DA:1921,3
		DA:1933,1
		DA:1934,1
		DA:1937,0
		DA:1938,0
		DA:1939,0
		DA:1885,2
		DA:1886,2
		DA:1887,1
		DA:1888,6
		DA:1900,1
		DA:1902,0
		DA:1904,1
		DA:1919,3
		DA:1920,3
		DA:1923,1
		DA:1924,3
		DA:1936,1
		DA:1937,1
		DA:1940,0
		DA:1941,0
		DA:1945,0
		DA:1946,0
		DA:1947,0
		DA:1942,0
		DA:1944,0
		DA:1948,0
		DA:1949,0
		DA:1953,0
		DA:1955,0
		DA:1950,0
		DA:1952,0
		DA:1956,0
		DA:1963,1
		DA:1965,2
		DA:1958,0
		DA:1959,0
		DA:1966,1
		DA:1967,1
		DA:1969,3
		DA:1982,2
		DA:1983,2
		DA:1984,4
		DA:1985,3
		DA:1986,9
		DA:1987,6
		DA:1989,1
		DA:1990,3
		DA:1991,1
		DA:1968,2
		DA:1969,1
		DA:1970,1
		DA:1972,3
		DA:1985,2
		DA:1986,2
		DA:1987,4
		DA:1988,3
		DA:1989,9
		DA:1990,6
		DA:1992,1
		DA:1993,3
		DA:1994,1
		DA:1996,1
		DA:1997,4
		DA:1997,1
		DA:1999,1
		DA:2000,3
		LF:723
		LH:294
		DA:2000,4
		DA:2002,1
		DA:2003,3
		LF:725
		LH:299
		end_of_record

pipe-cli/Cargo.toml

+1 −0

Original line number	Diff line number	Diff line
		@@ -17,6 +17,7 @@ clap-verbosity-flag = { workspace = true }
		color-eyre = { workspace = true }
		dotenvy = { workspace = true }
		exitcode = { workspace = true }
		owo-colors = { workspace = true }
		rayon = { workspace = true }
		serde = { workspace = true }
		serde_json = { workspace = true }

pipe-cli/src/commands/run/mod.rs

+28 −11

Original line number	Diff line number	Diff line
		use clap_verbosity_flag::Verbosity;
		use color_eyre::eyre::Report;
		use nanoid::nanoid;
		use owo_colors::OwoColorize;
		use pipe_lib::{Config, ConfigOptions, EnvironmentValue, Label};
		use rayon::prelude::*;
		use std::env;
		@@ -14,10 +15,10 @@ pub fn run(
		config: &Option<PathBuf>,
		_reporter: &Option<Vec<String>>,
		_output: &Option<PathBuf>,
		dry_run: bool,
		offline: bool,
		skip_verify_checksum: bool,
		skip_verify_requirements: bool,
		cli_dry_run: bool,
		cli_offline: bool,
		cli_skip_verify_checksum: bool,
		cli_skip_verify_requirements: bool,
		_verbose: Verbosity,
		) -> Result<(), Report> {
		let id = nanoid!(10, &nanoid::alphabet::SAFE);
		@@ -43,13 +44,29 @@ pub fn run(
		};
		match Config::read(config_path) {
		\| Some(cfg) => {
		let options = ConfigOptions::init()
		let options = match &cfg.options {
		\| Some(ConfigOptions {
		dry_run,
		offline,
		skip_verify_checksum,
		skip_verify_requirements,
		..
		}) => ConfigOptions::init()
		.root(root.clone())
		.dry_run(dry_run)
		.offline(offline)
		.skip_verify_checksum(skip_verify_checksum)
		.skip_verify_requirements(skip_verify_requirements)
		.build();
		.dry_run(cli_dry_run \|\| dry_run.unwrap_or_default())
		.offline(cli_offline \|\| offline.unwrap_or_default())
		.skip_verify_checksum(cli_skip_verify_checksum \|\| skip_verify_checksum.unwrap_or_default())
		.skip_verify_requirements(cli_skip_verify_requirements \|\| skip_verify_requirements.unwrap_or_default())
		.build(),
		\| None => ConfigOptions::init()
		.root(root.clone())
		.dry_run(cli_dry_run)
		.offline(cli_offline)
		.skip_verify_checksum(cli_skip_verify_checksum)
		.skip_verify_requirements(cli_skip_verify_requirements)
		.build(),
		};
		debug!("=> {} Run configuration options = {}", Label::using(), format!("{:#?}", options).dimmed());
		let config = cfg
		.verify_requirements(&options)
		.verify_resources(&options)