feat: Rename all instances of PIPE to Xylem; remove has_extension function (b1004eb4) · Commits · Research Enablement / Xylem

Cargo.lock

+131 −1576

File changed.

Preview size limit exceeded, changes collapsed.

lcov.info

+87 −89

Original line number	Diff line number	Diff line
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-cli/src/commands/check/checks/is_valid_python_module/mod.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-cli/src/commands/check/checks/is_valid_python_module/mod.rs
		FN:16,run
		FNF:1
		FNDA:0,run
		@@ -9,7 +9,7 @@ LF:2
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-cli/src/commands/check/checks/template/mod.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-cli/src/commands/check/checks/template/mod.rs
		FN:6,_run
		FNF:1
		FNDA:0,_run
		@@ -19,7 +19,7 @@ LF:2
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-cli/src/commands/check/mod.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-cli/src/commands/check/mod.rs
		FN:22,run
		FNF:1
		FNDA:0,run
		@@ -98,7 +98,7 @@ LF:71
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-cli/src/commands/doctor/mod.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-cli/src/commands/doctor/mod.rs
		FN:6,run
		FNF:1
		FNDA:0,run
		@@ -107,7 +107,7 @@ LF:1
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-cli/src/commands/run/mod.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-cli/src/commands/run/mod.rs
		FN:16,run
		FNF:1
		FNDA:0,run
		@@ -156,7 +156,7 @@ LF:41
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-cli/src/main.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-cli/src/main.rs
		FN:26,main
		FNF:1
		FNDA:0,main
		@@ -183,7 +183,7 @@ LF:19
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-cli/src/reporters/console/mod.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-cli/src/reporters/console/mod.rs
		FN:5,run
		FN:43,print_pass
		FN:52,print_fail
		@@ -225,7 +225,7 @@ LF:30
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-cli/src/reporters/json/mod.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-cli/src/reporters/json/mod.rs
		FN:10,run
		FNF:1
		FNDA:0,run
		@@ -263,7 +263,7 @@ LF:30
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-cli/src/reporters/stdout/mod.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-cli/src/reporters/stdout/mod.rs
		FN:5,run
		FNF:1
		FNDA:0,run
		@@ -273,7 +273,7 @@ LF:2
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-lib/src/config.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-lib/src/config.rs
		FN:119,Config::get_environment_variables
		FN:139,Config::get_inputs
		FN:169,Config::get_module_list
		@@ -458,7 +458,7 @@ DA:414,2
		DA:415,1
		DA:416,0
		DA:420,6
		DA:421,3
		DA:421,2
		DA:423,0
		DA:424,0
		DA:432,1
		@@ -467,11 +467,11 @@ DA:434,2
		DA:436,0
		DA:437,0
		DA:440,2
		DA:441,4
		DA:442,8
		DA:441,3
		DA:442,2
		DA:443,0
		DA:445,8
		DA:446,4
		DA:445,4
		DA:446,3
		DA:453,1
		DA:454,2
		DA:455,1
		@@ -567,7 +567,7 @@ LF:262
		LH:42
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-lib/src/lib.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-lib/src/lib.rs
		FN:81,<impl PartialEq for Details>::eq
		FN:88,<impl Deref for PyProjectToml>::deref
		FN:93,PyProjectToml::read
		@@ -608,7 +608,7 @@ LF:25
		LH:20
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-lib/src/script.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-lib/src/script.rs
		FN:300,Command::test
		FN:324,EnvironmentValue::formatted_prefix
		FN:329,EnvironmentValue::from_value
		@@ -661,7 +661,7 @@ FNDA:1,EnvironmentValue::get_all
		FNDA:0,EnvironmentValue::print_all
		FNDA:0,EnvironmentValue::set_variable
		FNDA:0,EnvironmentValue::set_variables
		FNDA:2,ModuleUri<'_>::from
		FNDA:1,ModuleUri<'_>::from
		FNDA:1,ModuleUri<'_>::hash
		FNDA:0,ModuleUri<'_>::get_whitelist
		FNDA:0,ModuleUri<'_>::is_allowed
		@@ -686,17 +686,17 @@ FNDA:0,Script::with_envs
		FNDA:1,Script::with_virtual_environment
		FNDA:1,ScriptTemplate::from_path
		FNDA:0,ScriptTemplate::resolve_python_virtual_environment
		FNDA:2,StringTemplate::new
		FNDA:1,StringTemplate::new
		FNDA:1,StringTemplate::expand
		FNDA:1,StringTemplate::get_variable
		FNDA:2,StringTemplate::is_handlebars
		FNDA:1,StringTemplate::is_handlebars
		FNDA:1,StringTemplate::remove_spaces
		FNDA:1,get_conda_environment_list
		DA:300,1
		DA:301,2
		DA:302,1
		DA:303,2
		DA:304,5
		DA:304,4
		DA:306,4
		DA:307,2
		DA:310,0
		@@ -749,9 +749,9 @@ DA:386,0
		DA:390,0
		DA:391,0
		DA:393,0
		DA:397,2
		DA:398,2
		DA:399,3
		DA:397,1
		DA:398,1
		DA:399,4
		DA:400,1
		DA:401,2
		DA:402,0
		@@ -853,14 +853,14 @@ DA:645,1
		DA:646,1
		DA:648,1
		DA:650,1
		DA:651,2
		DA:651,1
		DA:652,1
		DA:653,2
		DA:655,2
		DA:653,1
		DA:655,1
		DA:656,2
		DA:657,2
		DA:657,1
		DA:660,1
		DA:661,2
		DA:661,1
		DA:662,1
		DA:663,1
		DA:664,1
		@@ -870,8 +870,8 @@ DA:668,0
		DA:669,0
		DA:672,2
		DA:673,1
		DA:675,3
		DA:677,3
		DA:675,1
		DA:677,1
		DA:678,1
		DA:679,1
		DA:680,2
		@@ -883,7 +883,7 @@ DA:688,0
		DA:689,0
		DA:692,1
		DA:693,1
		DA:695,3
		DA:695,2
		DA:700,0
		DA:701,0
		DA:702,0
		@@ -921,22 +921,22 @@ DA:758,0
		DA:762,1
		DA:763,1
		DA:764,1
		DA:765,3
		DA:766,3
		DA:767,3
		DA:765,2
		DA:766,2
		DA:767,2
		DA:768,1
		DA:769,9
		DA:770,2
		DA:771,1
		DA:772,1
		DA:772,2
		DA:773,1
		DA:774,1
		DA:779,2
		DA:780,2
		DA:779,4
		DA:780,1
		DA:782,0
		DA:783,0
		DA:786,2
		DA:787,2
		DA:786,1
		DA:787,1
		DA:788,2
		DA:789,2
		DA:792,2
		@@ -996,10 +996,10 @@ DA:915,0
		DA:920,0
		DA:921,0
		DA:922,0
		DA:932,2
		DA:934,2
		DA:932,1
		DA:934,1
		DA:941,1
		DA:942,5
		DA:942,4
		DA:943,3
		DA:948,1
		DA:949,2
		@@ -1007,17 +1007,17 @@ DA:950,3
		DA:951,1
		DA:952,2
		DA:954,0
		DA:978,2
		DA:979,4
		DA:978,1
		DA:979,2
		DA:980,3
		DA:981,2
		DA:981,1
		DA:982,0
		DA:984,0
		DA:1013,1
		DA:1014,2
		DA:1015,1
		DA:1016,0
		DA:1018,4
		DA:1018,3
		DA:1019,1
		DA:1023,1
		DA:1024,1
		@@ -1034,7 +1034,7 @@ LF:338
		LH:184
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/re/pipe/pipe-lib/src/util.rs
		SF:/root/dev/re/xylem/xylem-lib/src/util.rs
		FN:25,Label::dry_run
		FN:29,Label::invalid
		FN:32,Label::fmt_invalid
		@@ -1071,8 +1071,8 @@ FNDA:0,Label::pass
		FNDA:0,Label::read
		FNDA:0,Label::rejected
		FNDA:0,Label::run
		FNDA:4,Label::using
		FNDA:4,Label::fmt_using
		FNDA:3,Label::using
		FNDA:3,Label::fmt_using
		FNDA:1,add_dot_slash
		FNDA:1,add_forward_slash
		FNDA:0,download_binary
		@@ -1103,7 +1103,7 @@ DA:54,1
		DA:55,1
		DA:57,1
		DA:58,2
		DA:59,2
		DA:59,1
		DA:61,0
		DA:62,0
		DA:63,0
		@@ -1116,11 +1116,11 @@ DA:71,0
		DA:73,0
		DA:74,0
		DA:75,0
		DA:77,4
		DA:78,4
		DA:80,4
		DA:81,4
		DA:82,4
		DA:77,3
		DA:78,1
		DA:80,3
		DA:81,1
		DA:82,3
		DA:86,1
		DA:87,2
		DA:88,2
		@@ -1163,38 +1163,36 @@ DA:202,3
		DA:203,3
		DA:206,1
		DA:207,2
		DA:219,1
		DA:220,1
		DA:223,0
		DA:224,0
		DA:225,0
		DA:227,0
		DA:231,0
		DA:232,0
		DA:233,0
		DA:235,0
		DA:239,0
		DA:241,0
		DA:242,0
		DA:249,1
		DA:251,2
		DA:252,1
		DA:253,1
		DA:210,0
		DA:211,0
		DA:212,0
		DA:214,0
		DA:218,0
		DA:219,0
		DA:220,0
		DA:222,0
		DA:226,0
		DA:228,0
		DA:229,0
		DA:236,1
		DA:238,2
		DA:239,1
		DA:240,1
		DA:242,2
		DA:255,2
		DA:268,2
		DA:269,2
		DA:270,4
		DA:271,3
		DA:272,6
		DA:273,6
		DA:275,1
		DA:276,2
		DA:277,1
		DA:280,1
		DA:282,1
		DA:283,3
		DA:285,1
		DA:286,4
		LF:117
		LH:53
		DA:256,2
		DA:257,4
		DA:258,3
		DA:259,6
		DA:260,6
		DA:262,1
		DA:263,2
		DA:264,1
		DA:267,1
		DA:269,1
		DA:270,3
		DA:272,1
		DA:273,4
		LF:115
		LH:51
		end_of_record

xylem-cli/Cargo.toml

+6 −5

Original line number	Diff line number	Diff line
		[package]
		name = "pipe-cli"
		name = "xylem-cli"
		version.workspace = true
		authors.workspace = true
		description.workspace = true
		documentation.workspace = true
		edition = "2021"

		[[bin]]
		name = "xylem"
		path = "src/main.rs"

		[dependencies]
		pipe-lib = { path = "../pipe-lib" }
		xylem-lib = { path = "../xylem-lib" }
		clap = { version = "4.4.2", features = ["derive", "unstable-doc"] }
		console = { version = "0.15.7", default-features = false, features = ["ansi-parsing"] }
		glob = "0.3.1"
		@@ -27,8 +31,5 @@ tracing-subscriber = { workspace = true }
		uriparse = { workspace = true }
		assert_cmd = "2.0.16"

		[dev-dependencies]
		cargo-watch = "8.4.1"

		[lints.rust]
		unsafe_code = "forbid"

xylem-cli/src/commands/check/checks/is_valid_python_module/mod.rs

+2 −2

Original line number	Diff line number	Diff line
		@@ -8,9 +8,9 @@
		//! - └── environment.yml
		//! ```

		use pipe_lib::config::Parameters;
		use pipe_lib::Output;
		use std::path::Path;
		use xylem_lib::config::Parameters;
		use xylem_lib::Output;

		/// Process check on a given path to a directory
		pub fn run(_item: &Path, _: Option<Parameters>) -> Output {

xylem-cli/src/commands/check/checks/template/mod.rs

+2 −2

Original line number	Diff line number	Diff line
		use pipe_lib::config::Parameters;
		use pipe_lib::Output;
		use std::path::Path;
		use xylem_lib::config::Parameters;
		use xylem_lib::Output;

		/// Process check on a given path to a directory
		pub fn _run(_item: &Path, _: Option<Parameters>) -> Output {