feat: Complete template resolution capability (156e4b31) · Commits · Research Enablement / Xylem

lcov.info

+514 −477

Original line number	Diff line number	Diff line
		@@ -20,30 +20,29 @@ LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/command/pipe-cli/src/commands/check/mod.rs
		FN:19,run
		FN:20,run
		FNF:1
		FNDA:0,run
		DA:19,0
		DA:29,0
		DA:20,0
		DA:30,0
		DA:31,0
		DA:33,0
		DA:32,0
		DA:34,0
		DA:36,0
		DA:35,0
		DA:37,0
		DA:38,0
		DA:41,0
		DA:39,0
		DA:42,0
		DA:43,0
		DA:44,0
		DA:46,0
		DA:45,0
		DA:47,0
		DA:51,0
		DA:48,0
		DA:52,0
		DA:55,0
		DA:57,0
		DA:66,0
		DA:68,0
		DA:53,0
		DA:56,0
		DA:58,0
		DA:67,0
		DA:69,0
		DA:70,0
		DA:71,0
		@@ -52,26 +51,26 @@ DA:73,0
		DA:74,0
		DA:75,0
		DA:76,0
		DA:78,0
		DA:81,0
		DA:87,0
		DA:77,0
		DA:79,0
		DA:82,0
		DA:88,0
		DA:89,0
		DA:92,0
		DA:94,0
		DA:90,0
		DA:93,0
		DA:95,0
		DA:96,0
		DA:97,0
		DA:98,0
		DA:99,0
		DA:101,0
		DA:103,0
		DA:100,0
		DA:102,0
		DA:104,0
		DA:105,0
		DA:106,0
		DA:107,0
		DA:108,0
		DA:111,0
		DA:109,0
		DA:112,0
		DA:113,0
		DA:114,0
		@@ -80,20 +79,21 @@ DA:116,0
		DA:117,0
		DA:118,0
		DA:119,0
		DA:121,0
		DA:120,0
		DA:122,0
		DA:123,0
		DA:124,0
		DA:127,0
		DA:125,0
		DA:128,0
		DA:130,0
		DA:129,0
		DA:131,0
		DA:132,0
		DA:134,0
		DA:133,0
		DA:135,0
		DA:137,0
		DA:136,0
		DA:138,0
		DA:140,0
		DA:139,0
		DA:141,0
		LF:71
		LH:0
		end_of_record
		@@ -108,98 +108,98 @@ LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/command/pipe-cli/src/commands/run/mod.rs
		FN:20,run
		FN:18,run
		FNF:1
		FNDA:0,run
		DA:20,0
		DA:18,0
		DA:28,0
		DA:29,0
		DA:30,0
		DA:31,0
		DA:32,0
		DA:34,0
		DA:33,0
		DA:35,0
		DA:37,0
		DA:38,0
		DA:39,0
		DA:40,0
		DA:41,0
		DA:43,0
		DA:42,0
		DA:44,0
		DA:45,0
		DA:46,0
		DA:47,0
		DA:48,0
		DA:51,0
		DA:49,0
		DA:50,0
		DA:52,0
		DA:53,0
		DA:54,0
		DA:55,0
		DA:56,0
		DA:57,0
		DA:58,0
		DA:59,0
		DA:63,0
		DA:61,0
		DA:64,0
		DA:65,0
		DA:66,0
		DA:67,0
		DA:68,0
		DA:70,0
		DA:71,0
		DA:69,0
		DA:73,0
		DA:77,0
		DA:79,0
		DA:81,0
		DA:83,0
		DA:85,0
		DA:88,0
		DA:89,0
		DA:87,0
		DA:90,0
		DA:93,0
		DA:91,0
		DA:92,0
		DA:95,0
		DA:96,0
		DA:97,0
		DA:98,0
		DA:99,0
		DA:104,0
		DA:101,0
		DA:106,0
		DA:108,0
		DA:110,0
		DA:111,0
		DA:115,0
		DA:116,0
		DA:112,0
		DA:113,0
		DA:117,0
		DA:120,0
		DA:118,0
		DA:119,0
		DA:122,0
		DA:123,0
		DA:124,0
		DA:125,0
		DA:128,0
		DA:129,0
		DA:127,0
		DA:130,0
		DA:131,0
		DA:132,0
		DA:133,0
		DA:134,0
		DA:135,0
		DA:136,0
		DA:137,0
		DA:138,0
		DA:139,0
		DA:140,0
		DA:141,0
		DA:151,0
		DA:152,0
		DA:143,0
		DA:153,0
		DA:154,0
		DA:155,0
		DA:156,0
		DA:160,0
		DA:158,0
		DA:162,0
		DA:164,0
		DA:165,0
		DA:169,0
		DA:179,0
		DA:180,0
		DA:166,0
		DA:167,0
		DA:171,0
		DA:181,0
		DA:182,0
		DA:183,0
		DA:184,0
		DA:189,0
		DA:190,0
		DA:194,0
		DA:197,0
		DA:200,0
		DA:186,0
		DA:191,0
		DA:192,0
		DA:196,0
		DA:199,0
		DA:202,0
		DA:204,0
		DA:207,0
		DA:208,0
		DA:206,0
		DA:209,0
		DA:210,0
		DA:211,0
		@@ -208,52 +208,44 @@ DA:213,0
		DA:214,0
		DA:215,0
		DA:216,0
		DA:217,0
		DA:218,0
		DA:221,0
		DA:224,0
		DA:227,0
		DA:220,0
		DA:223,0
		DA:226,0
		DA:229,0
		DA:230,0
		DA:231,0
		DA:232,0
		DA:233,0
		DA:234,0
		DA:235,0
		DA:236,0
		DA:237,0
		DA:240,0
		DA:243,0
		DA:247,0
		DA:248,0
		DA:239,0
		DA:242,0
		DA:245,0
		DA:249,0
		DA:250,0
		DA:251,0
		DA:253,0
		DA:252,0
		DA:254,0
		DA:255,0
		DA:256,0
		DA:257,0
		DA:258,0
		DA:259,0
		DA:260,0
		DA:261,0
		DA:262,0
		DA:263,0
		DA:265,0
		DA:267,0
		DA:271,0
		DA:264,0
		DA:266,0
		DA:269,0
		DA:272,0
		DA:274,0
		DA:275,0
		DA:277,0
		DA:278,0
		DA:279,0
		DA:280,0
		DA:281,0
		DA:283,0
		DA:286,0
		DA:289,0
		DA:292,0
		DA:294,0
		DA:297,0
		DA:299,0
		LF:142
		DA:282,0
		LF:134
		LH:0
		end_of_record
		TN:
		@@ -376,64 +368,68 @@ LH:0
		end_of_record
		TN:
		SF:/root/dev/command/pipe-lib/src/lib.rs
		FN:444,Command::test
		FN:467,Config::read
		FN:491,Config::read_json
		FN:512,Config::read_yaml
		FN:529,Config::set_environment_variables
		FN:543,<impl PartialEq for Details>::eq
		FN:550,EnvironmentValue::from_string
		FN:553,EnvironmentValue::from_value
		FN:561,EnvironmentValue::prepend_prefix
		FN:565,EnvironmentValue::trim_prefix
		FN:569,EnvironmentValue::get_from_config
		FN:576,EnvironmentValue::get_from_serde
		FN:590,EnvironmentValue::get_all
		FN:600,EnvironmentValue::print_all
		FN:605,EnvironmentValue::set_variable
		FN:615,EnvironmentValue::set_variables
		FN:622,Extension::from_string
		FN:631,Label::dry_run
		FN:635,Label::invalid
		FN:639,Label::fail
		FN:643,Label::found
		FN:647,Label::not_found
		FN:651,Label::output
		FN:655,Label::read
		FN:659,Label::rejected
		FN:663,Label::run
		FN:667,Label::using
		FN:673,ModuleUri<'_>::from
		FN:683,ModuleUri<'_>::hash
		FN:707,ModuleUri<'_>::get_whitelist
		FN:710,ModuleUri<'_>::is_allowed
		FN:713,ModuleUri<'_>::test
		FN:714,ModuleUri<'_>::test::check
		FN:731,ModuleUri<'_>::working_directory
		FN:743,SemanticVersion::from_string
		FN:766,Script::expand_arguments
		FN:801,Script::expand_arguments_from
		FN:836,Script::from_module
		FN:894,Script::from_path
		FN:917,Script::from_template
		FN:937,Script::get_command
		FN:947,Script::get_arguments
		FN:987,Script::maybe_create_virtual_environment
		FN:1024,Script::maybe_git_clone
		FN:1031,Script::python_default
		FN:1045,Script::run
		FN:1112,Script::with_container
		FN:1119,Script::with_current_dir
		FN:1124,Script::with_envs
		FN:1166,Script::with_virtual_environment
		FN:1175,StringTemplate::new
		FN:1184,StringTemplate::expand
		FN:1191,StringTemplate::get_variable
		FN:1221,StringTemplate::is_handlebars
		FN:1256,StringTemplate::remove_spaces
		FN:1266,add_dot_slash
		FN:1274,add_forward_slash
		FNF:57
		FN:446,Command::test
		FN:469,Config::read
		FN:493,Config::read_json
		FN:514,Config::read_yaml
		FN:531,Config::set_environment_variables
		FN:545,<impl PartialEq for Details>::eq
		FN:552,EnvironmentValue::from_string
		FN:555,EnvironmentValue::from_value
		FN:563,EnvironmentValue::prepend_prefix
		FN:567,EnvironmentValue::trim_prefix
		FN:571,EnvironmentValue::get_from_config
		FN:578,EnvironmentValue::get_from_serde
		FN:592,EnvironmentValue::get_all
		FN:602,EnvironmentValue::print_all
		FN:607,EnvironmentValue::set_variable
		FN:617,EnvironmentValue::set_variables
		FN:624,Extension::from_string
		FN:633,Label::dry_run
		FN:637,Label::invalid
		FN:641,Label::fail
		FN:645,Label::found
		FN:649,Label::not_found
		FN:653,Label::output
		FN:657,Label::read
		FN:661,Label::rejected
		FN:665,Label::run
		FN:669,Label::using
		FN:675,ModuleUri<'_>::from
		FN:685,ModuleUri<'_>::hash
		FN:709,ModuleUri<'_>::get_whitelist
		FN:712,ModuleUri<'_>::is_allowed
		FN:715,ModuleUri<'_>::test
		FN:716,ModuleUri<'_>::test::check
		FN:733,ModuleUri<'_>::working_directory
		FN:745,SemanticVersion::from_string
		FN:768,Script::expand_arguments
		FN:803,Script::expand_arguments_from
		FN:838,Script::from_module
		FN:896,Script::from_path
		FN:911,Script::from_template
		FN:931,Script::get_command
		FN:941,Script::get_arguments
		FN:981,Script::maybe_create_virtual_environment
		FN:1026,Script::maybe_git_clone
		FN:1033,Script::python_default
		FN:1047,Script::run
		FN:1114,Script::with_container
		FN:1121,Script::with_current_dir
		FN:1126,Script::with_envs
		FN:1168,Script::with_virtual_environment
		FN:1174,ScriptTemplate::from_path
		FN:1186,ScriptTemplate::resolve_python_virtual_environment
		FN:1214,StringTemplate::new
		FN:1223,StringTemplate::expand
		FN:1230,StringTemplate::get_variable
		FN:1260,StringTemplate::is_handlebars
		FN:1295,StringTemplate::remove_spaces
		FN:1305,add_dot_slash
		FN:1313,add_forward_slash
		FN:1320,download_binary
		FN:1321,download_binary::download
		FNF:61
		FNDA:1,Command::test
		FNDA:1,Config::read
		FNDA:1,Config::read_json
		@@ -461,7 +457,7 @@ FNDA:0,Label::read
		FNDA:0,Label::rejected
		FNDA:0,Label::run
		FNDA:0,Label::using
		FNDA:2,ModuleUri<'_>::from
		FNDA:1,ModuleUri<'_>::from
		FNDA:1,ModuleUri<'_>::hash
		FNDA:0,ModuleUri<'_>::get_whitelist
		FNDA:0,ModuleUri<'_>::is_allowed
		@@ -484,6 +480,8 @@ FNDA:1,Script::with_container
		FNDA:1,Script::with_current_dir
		FNDA:0,Script::with_envs
		FNDA:1,Script::with_virtual_environment
		FNDA:1,ScriptTemplate::from_path
		FNDA:0,ScriptTemplate::resolve_python_virtual_environment
		FNDA:1,StringTemplate::new
		FNDA:1,StringTemplate::expand
		FNDA:1,StringTemplate::get_variable
		@@ -491,81 +489,81 @@ FNDA:1,StringTemplate::is_handlebars
		FNDA:1,StringTemplate::remove_spaces
		FNDA:1,add_dot_slash
		FNDA:1,add_forward_slash
		DA:444,1
		DA:445,2
		FNDA:0,download_binary
		FNDA:0,download_binary::download
		DA:446,1
		DA:447,4
		DA:448,4
		DA:450,6
		DA:451,2
		DA:454,0
		DA:455,0
		DA:460,3
		DA:461,1
		DA:467,1
		DA:468,2
		DA:469,2
		DA:470,1
		DA:471,0
		DA:473,2
		DA:474,1
		DA:475,0
		DA:479,2
		DA:480,1
		DA:482,0
		DA:483,0
		DA:491,1
		DA:492,2
		DA:493,2
		DA:495,0
		DA:496,0
		DA:499,3
		DA:500,2
		DA:501,4
		DA:502,0
		DA:504,6
		DA:505,2
		DA:512,1
		DA:513,2
		DA:447,2
		DA:448,1
		DA:449,3
		DA:450,2
		DA:452,3
		DA:453,1
		DA:456,0
		DA:457,0
		DA:462,3
		DA:463,1
		DA:469,1
		DA:470,2
		DA:471,2
		DA:472,1
		DA:473,0
		DA:475,2
		DA:476,1
		DA:477,0
		DA:481,2
		DA:482,1
		DA:484,0
		DA:485,0
		DA:493,1
		DA:494,2
		DA:495,2
		DA:497,0
		DA:498,0
		DA:501,2
		DA:502,1
		DA:503,2
		DA:504,0
		DA:506,3
		DA:507,1
		DA:514,1
		DA:516,0
		DA:517,0
		DA:520,2
		DA:521,1
		DA:515,2
		DA:516,1
		DA:518,0
		DA:519,0
		DA:522,2
		DA:523,0
		DA:525,3
		DA:526,1
		DA:529,0
		DA:530,0
		DA:523,1
		DA:524,2
		DA:525,0
		DA:527,3
		DA:528,1
		DA:531,0
		DA:532,0
		DA:533,0
		DA:534,0
		DA:539,0
		DA:543,1
		DA:544,1
		DA:550,0
		DA:551,0
		DA:535,0
		DA:536,0
		DA:541,0
		DA:545,1
		DA:546,1
		DA:552,0
		DA:553,0
		DA:554,0
		DA:555,0
		DA:556,0
		DA:557,0
		DA:558,0
		DA:561,0
		DA:562,0
		DA:565,1
		DA:566,1
		DA:567,2
		DA:569,0
		DA:570,0
		DA:559,0
		DA:560,0
		DA:563,0
		DA:564,0
		DA:567,1
		DA:568,1
		DA:569,2
		DA:571,0
		DA:572,0
		DA:573,0
		DA:574,0
		DA:575,0
		DA:576,0
		DA:577,0
		DA:578,0
		DA:579,0
		DA:580,0
		@@ -573,369 +571,408 @@ DA:581,0
		DA:582,0
		DA:583,0
		DA:584,0
		DA:585,0
		DA:586,0
		DA:588,0
		DA:590,1
		DA:591,1
		DA:592,2
		DA:593,2
		DA:590,0
		DA:592,1
		DA:593,1
		DA:594,2
		DA:595,2
		DA:596,1
		DA:600,0
		DA:601,0
		DA:596,2
		DA:597,2
		DA:598,1
		DA:602,0
		DA:605,0
		DA:606,0
		DA:603,0
		DA:604,0
		DA:607,0
		DA:608,0
		DA:609,0
		DA:610,0
		DA:611,0
		DA:615,0
		DA:616,0
		DA:612,0
		DA:613,0
		DA:617,0
		DA:618,0
		DA:622,1
		DA:623,2
		DA:624,2
		DA:625,3
		DA:626,0
		DA:631,0
		DA:632,0
		DA:620,0
		DA:624,1
		DA:625,2
		DA:626,2
		DA:627,3
		DA:628,0
		DA:633,0
		DA:634,0
		DA:635,0
		DA:636,0
		DA:637,0
		DA:638,0
		DA:639,0
		DA:640,0
		DA:641,0
		DA:642,0
		DA:643,0
		DA:644,0
		DA:645,0
		DA:646,0
		DA:647,0
		DA:648,0
		DA:649,0
		DA:651,1
		DA:652,3
		DA:653,3
		DA:655,0
		DA:656,0
		DA:650,0
		DA:651,0
		DA:653,1
		DA:654,1
		DA:655,1
		DA:657,0
		DA:658,0
		DA:659,0
		DA:660,0
		DA:661,0
		DA:662,0
		DA:663,0
		DA:664,0
		DA:665,0
		DA:666,0
		DA:667,0
		DA:668,0
		DA:669,0
		DA:673,2
		DA:674,2
		DA:675,5
		DA:670,0
		DA:671,0
		DA:675,1
		DA:676,2
		DA:677,2
		DA:678,0
		DA:680,1
		DA:683,1
		DA:684,1
		DA:677,3
		DA:678,1
		DA:679,2
		DA:680,0
		DA:682,1
		DA:685,1
		DA:686,1
		DA:687,2
		DA:688,0
		DA:690,4
		DA:694,4
		DA:695,4
		DA:697,4
		DA:698,2
		DA:687,1
		DA:688,1
		DA:689,1
		DA:690,0
		DA:692,2
		DA:696,2
		DA:697,2
		DA:699,2
		DA:700,2
		DA:703,0
		DA:707,0
		DA:708,0
		DA:702,1
		DA:705,0
		DA:709,0
		DA:710,0
		DA:711,0
		DA:712,0
		DA:713,0
		DA:714,0
		DA:715,0
		DA:716,0
		DA:717,0
		DA:718,0
		DA:719,0
		DA:720,0
		DA:721,0
		DA:722,0
		DA:723,0
		DA:724,0
		DA:725,0
		DA:727,0
		DA:731,0
		DA:732,0
		DA:729,0
		DA:733,0
		DA:734,0
		DA:735,0
		DA:736,0
		DA:737,0
		DA:738,0
		DA:743,1
		DA:744,1
		DA:745,3
		DA:746,3
		DA:739,0
		DA:740,0
		DA:745,1
		DA:746,1
		DA:747,3
		DA:766,1
		DA:767,2
		DA:770,2
		DA:771,1
		DA:748,3
		DA:749,3
		DA:768,1
		DA:769,2
		DA:772,2
		DA:773,1
		DA:774,1
		DA:776,2
		DA:780,1
		DA:781,1
		DA:801,1
		DA:802,2
		DA:805,2
		DA:806,1
		DA:774,2
		DA:775,1
		DA:776,1
		DA:778,2
		DA:782,1
		DA:783,1
		DA:803,1
		DA:804,2
		DA:807,2
		DA:808,2
		DA:811,2
		DA:813,1
		DA:815,2
		DA:819,1
		DA:820,1
		DA:836,0
		DA:808,1
		DA:809,2
		DA:810,2
		DA:813,2
		DA:815,1
		DA:817,2
		DA:821,1
		DA:822,1
		DA:838,0
		DA:839,0
		DA:840,0
		DA:843,0
		DA:844,0
		DA:841,0
		DA:842,0
		DA:845,0
		DA:846,0
		DA:847,0
		DA:848,0
		DA:849,0
		DA:850,0
		DA:851,0
		DA:854,0
		DA:855,0
		DA:852,0
		DA:853,0
		DA:856,0
		DA:857,0
		DA:860,0
		DA:861,0
		DA:858,0
		DA:859,0
		DA:862,0
		DA:865,0
		DA:863,0
		DA:864,0
		DA:867,0
		DA:868,0
		DA:871,0
		DA:877,0
		DA:878,0
		DA:894,1
		DA:895,2
		DA:869,0
		DA:870,0
		DA:873,0
		DA:879,0
		DA:880,0
		DA:896,1
		DA:898,0
		DA:899,0
		DA:902,2
		DA:903,1
		DA:904,1
		DA:917,1
		DA:918,1
		DA:919,3
		DA:923,2
		DA:925,2
		DA:927,2
		DA:897,1
		DA:898,1
		DA:911,1
		DA:912,1
		DA:913,3
		DA:917,2
		DA:919,2
		DA:921,2
		DA:925,1
		DA:926,1
		DA:927,1
		DA:929,2
		DA:931,1
		DA:932,1
		DA:933,1
		DA:935,2
		DA:937,1
		DA:934,1
		DA:936,1
		DA:937,2
		DA:938,1
		DA:939,1
		DA:940,1
		DA:941,1
		DA:942,1
		DA:943,2
		DA:943,1
		DA:944,1
		DA:947,1
		DA:948,1
		DA:949,1
		DA:950,1
		DA:951,1
		DA:952,1
		DA:953,0
		DA:955,0
		DA:956,0
		DA:959,2
		DA:945,1
		DA:946,1
		DA:947,0
		DA:949,0
		DA:950,0
		DA:953,2
		DA:954,1
		DA:956,1
		DA:958,1
		DA:959,1
		DA:960,1
		DA:962,1
		DA:961,2
		DA:962,2
		DA:964,1
		DA:965,1
		DA:966,1
		DA:966,2
		DA:967,2
		DA:968,2
		DA:970,1
		DA:972,2
		DA:973,2
		DA:975,0
		DA:976,0
		DA:979,1
		DA:980,1
		DA:982,1
		DA:969,0
		DA:970,0
		DA:973,1
		DA:974,1
		DA:976,1
		DA:981,0
		DA:986,0
		DA:987,0
		DA:988,0
		DA:990,0
		DA:991,0
		DA:992,0
		DA:993,0
		DA:994,0
		DA:996,0
		DA:995,0
		DA:997,0
		DA:998,0
		DA:999,0
		DA:1000,0
		DA:1001,0
		DA:1002,0
		DA:1003,0
		DA:1004,0
		DA:1005,0
		DA:1006,0
		DA:1007,0
		DA:1008,0
		DA:1009,0
		DA:1011,0
		DA:1012,0
		DA:1015,0
		DA:1019,0
		DA:1020,0
		DA:1024,1
		DA:1025,2
		DA:1026,2
		DA:1013,0
		DA:1014,0
		DA:1017,0
		DA:1022,0
		DA:1026,1
		DA:1027,2
		DA:1028,3
		DA:1029,1
		DA:1031,0
		DA:1032,0
		DA:1028,2
		DA:1029,2
		DA:1030,3
		DA:1031,1
		DA:1033,0
		DA:1041,0
		DA:1045,1
		DA:1046,1
		DA:1034,0
		DA:1035,0
		DA:1043,0
		DA:1047,1
		DA:1048,2
		DA:1049,2
		DA:1050,3
		DA:1051,1
		DA:1052,7
		DA:1053,2
		DA:1054,1
		DA:1055,1
		DA:1048,1
		DA:1049,1
		DA:1050,2
		DA:1051,2
		DA:1052,3
		DA:1053,1
		DA:1054,7
		DA:1055,2
		DA:1056,1
		DA:1057,1
		DA:1062,2
		DA:1063,1
		DA:1065,0
		DA:1066,0
		DA:1069,1
		DA:1070,1
		DA:1071,2
		DA:1072,2
		DA:1075,2
		DA:1076,1
		DA:1078,0
		DA:1079,0
		DA:1082,1
		DA:1083,1
		DA:1084,2
		DA:1085,0
		DA:1086,0
		DA:1089,2
		DA:1090,1
		DA:1091,3
		DA:1058,1
		DA:1059,1
		DA:1064,2
		DA:1065,1
		DA:1067,0
		DA:1068,0
		DA:1071,1
		DA:1072,1
		DA:1073,2
		DA:1074,2
		DA:1077,2
		DA:1078,1
		DA:1080,0
		DA:1081,0
		DA:1084,1
		DA:1085,1
		DA:1086,2
		DA:1087,0
		DA:1088,0
		DA:1091,2
		DA:1092,1
		DA:1093,3
		DA:1094,3
		DA:1095,1
		DA:1097,0
		DA:1098,0
		DA:1094,1
		DA:1095,3
		DA:1096,3
		DA:1097,1
		DA:1099,0
		DA:1102,0
		DA:1103,0
		DA:1100,0
		DA:1101,0
		DA:1104,0
		DA:1108,0
		DA:1109,0
		DA:1112,1
		DA:1113,1
		DA:1105,0
		DA:1106,0
		DA:1110,0
		DA:1111,0
		DA:1114,1
		DA:1119,1
		DA:1120,2
		DA:1115,1
		DA:1116,1
		DA:1121,1
		DA:1124,0
		DA:1125,0
		DA:1122,2
		DA:1123,1
		DA:1126,0
		DA:1166,1
		DA:1167,1
		DA:1127,0
		DA:1128,0
		DA:1168,1
		DA:1175,1
		DA:1177,1
		DA:1169,1
		DA:1170,1
		DA:1174,1
		DA:1175,2
		DA:1176,1
		DA:1178,0
		DA:1179,0
		DA:1182,2
		DA:1184,1
		DA:1185,4
		DA:1186,3
		DA:1191,1
		DA:1192,2
		DA:1193,2
		DA:1194,1
		DA:1195,2
		DA:1186,0
		DA:1187,0
		DA:1188,0
		DA:1189,0
		DA:1190,0
		DA:1191,0
		DA:1192,0
		DA:1193,0
		DA:1195,0
		DA:1196,0
		DA:1197,0
		DA:1221,1
		DA:1222,2
		DA:1223,2
		DA:1224,1
		DA:1225,0
		DA:1227,0
		DA:1256,1
		DA:1257,2
		DA:1258,1
		DA:1259,0
		DA:1261,3
		DA:1262,1
		DA:1266,1
		DA:1267,2
		DA:1268,2
		DA:1270,3
		DA:1274,1
		DA:1275,2
		DA:1276,0
		DA:1278,2
		DA:1291,1
		DA:1292,2
		DA:1293,2
		DA:1294,2
		DA:1295,2
		DA:1296,5
		DA:1299,1
		DA:1301,2
		DA:1303,4
		DA:1306,0
		DA:1333,1
		DA:1334,1
		DA:1335,1
		DA:1336,6
		DA:1348,1
		DA:1350,0
		DA:1365,1
		DA:1366,1
		DA:1369,1
		DA:1370,3
		DA:1382,1
		DA:1383,1
		DA:1386,0
		DA:1387,0
		DA:1388,0
		DA:1390,0
		DA:1394,0
		DA:1395,0
		DA:1396,0
		DA:1398,0
		DA:1412,2
		DA:1413,2
		DA:1414,6
		DA:1415,4
		DA:1416,12
		DA:1417,8
		DA:1419,1
		DA:1420,3
		DA:1421,1
		DA:1424,1
		DA:1426,1
		DA:1427,4
		LF:445
		LH:242
		DA:1202,0
		DA:1203,0
		DA:1204,0
		DA:1214,1
		DA:1216,1
		DA:1223,1
		DA:1224,4
		DA:1225,3
		DA:1230,1
		DA:1231,2
		DA:1232,2
		DA:1233,1
		DA:1234,2
		DA:1236,0
		DA:1260,1
		DA:1261,2
		DA:1262,2
		DA:1263,1
		DA:1264,0
		DA:1266,0
		DA:1295,1
		DA:1296,2
		DA:1297,1
		DA:1298,0
		DA:1300,3
		DA:1301,1
		DA:1305,1
		DA:1306,2
		DA:1307,2
		DA:1309,3
		DA:1313,1
		DA:1314,2
		DA:1315,0
		DA:1317,2
		DA:1320,0
		DA:1321,0
		DA:1322,0
		DA:1323,0
		DA:1324,0
		DA:1325,0
		DA:1326,0
		DA:1327,0
		DA:1328,0
		DA:1329,0
		DA:1330,0
		DA:1331,0
		DA:1333,0
		DA:1335,0
		DA:1338,0
		DA:1339,0
		DA:1340,0
		DA:1352,1
		DA:1353,2
		DA:1354,2
		DA:1355,2
		DA:1356,2
		DA:1357,5
		DA:1360,1
		DA:1362,2
		DA:1364,4
		DA:1367,0
		DA:1394,1
		DA:1395,2
		DA:1396,2
		DA:1397,1
		DA:1398,6
		DA:1410,1
		DA:1412,0
		DA:1414,1
		DA:1429,1
		DA:1430,1
		DA:1433,1
		DA:1434,3
		DA:1446,1
		DA:1447,1
		DA:1450,0
		DA:1451,0
		DA:1452,0
		DA:1454,0
		DA:1458,0
		DA:1459,0
		DA:1460,0
		DA:1462,0
		DA:1476,2
		DA:1477,1
		DA:1478,2
		DA:1479,1
		DA:1480,3
		DA:1481,3
		DA:1483,1
		DA:1484,3
		DA:1485,1
		DA:1488,1
		DA:1490,1
		DA:1491,4
		LF:482
		LH:246
		end_of_record

pipe-cli/src/commands/check/mod.rs

+1 −0

Original line number	Diff line number	Diff line
		@@ -16,6 +16,7 @@ use checks::*;

		const DEFAULT_CONFIG_NAME: &str = "config.json";

		#[allow(clippy::too_many_arguments)]
		pub fn run(
		path: &Option<PathBuf>,
		config: &Option<PathBuf>,

pipe-cli/src/commands/run/mod.rs

+8 −28

Original line number	Diff line number	Diff line
		@@ -2,10 +2,8 @@ use clap_verbosity_flag::Verbosity;
		use color_eyre::eyre::Report;
		use exitcode;
		use nanoid::nanoid;
		use pipe_lib::VirtualEnvironment;
		use pipe_lib::{
		get_conda_environment_name, get_parent, Command, Config, EnvironmentValue, Label, ModuleLanguage, ModuleType, ModuleUri, Script,
		TemplateAttribute, VirtualEnvironmentManager,
		get_parent, Command, Config, EnvironmentValue, Label, ModuleLanguage, ModuleType, ModuleUri, Script, ScriptTemplate, TemplateAttribute,
		};
		use rayon::prelude::*;
		use std::convert::TryFrom;
		@@ -17,6 +15,7 @@ use uriparse::URI;

		const DEFAULT_CONFIG_NAME: &str = "config.json";

		#[allow(clippy::too_many_arguments)]
		pub fn run(
		config: &Option<PathBuf>,
		_reporter: &Option<Vec<String>>,
		@@ -249,34 +248,15 @@ pub fn run(
		}
		\| ModuleLanguage::Python => {
		let working_dir = ModuleUri::from(uri).working_directory(Some(root.clone()));
		let loaded = Script::from_module(module.clone(), Some(root.clone()));
		let virtual_environment = match &module.template {
		\| Some(TemplateAttribute::Template(value)) => match &value.virtual_environment {
		\| Some(virtual_environment) => Some(virtual_environment.clone()),
		\| None => {
		let conda_manifest_path = PathBuf::from(&working_dir).join("environment.yml");
		match conda_manifest_path.try_exists() {
		\| Ok(_) => match get_conda_environment_name(conda_manifest_path.clone()) {
		\| Some(value) => {
		debug!(
		module = module.name,
		path = conda_manifest_path.to_str().unwrap(),
		"=> {} Manifest file",
		Label::using()
		);
		Some(VirtualEnvironment::init().name(value).manager(VirtualEnvironmentManager::Conda).build())
		\| Some(TemplateAttribute::Path(value)) => {
		ScriptTemplate::from_path(PathBuf::from(&working_dir).join(value)).virtual_environment
		}
		\| None => None,
		},
		\| Err(_) => None,
		}
		}
		},
		\| Some(TemplateAttribute::Path(_)) => None,
		\| None => None,
		\| Some(TemplateAttribute::Template(value)) => value.virtual_environment.clone(),
		\| None => ScriptTemplate::resolve_python_virtual_environment(PathBuf::from(working_dir.clone())),
		};
		let envs = EnvironmentValue::get_from_config(&cfg, Some(module.clone()));
		let script = loaded
		let script = Script::from_module(module.clone(), Some(root.clone()))
		.expand_arguments_from(envs)
		.with_current_dir(working_dir)
		.with_virtual_environment(virtual_environment);

pipe-lib/src/lib.rs

+79 −43

File changed.

Preview size limit exceeded, changes collapsed.